Syöpäsäätiöllä on hallitus, työvaliokunta ja raha-asiainvaliokunta. Hallitus Professori Seija Grénman, Turku, puheenjohtaja Akatemiaprofessori Jaakko Kaprio, Helsinki, varapuheenjohtaja Professori Klaus Elenius, Turku Professori Heikki Joensuu, Helsinki Ylilääkäri Ulla Keränen, Hyvinkää Dosentti Petri Koivunen, Oulu Professori Helena Kääriäinen, Helsinki Professori Jukka-Pekka Mecklin, Jyväskylä Toimitusjohtaja Timo Ritakallio, Helsinki Kansanedustaja Sari Sarkomaa, Helsinki Professori Tapio Visakorpi, Tampere Professori (emeritus) Eero Vuorio, Helsinki Syöpäsäätiön hallitus kokoontui kuusi kertaa. Työvaliokunta Professori Teuvo Tammela, puheenjohtaja Professori Seija Grénman, varapuheenjohtaja Professori Klaus Elenius Akatemiaprofessori Jaakko Kaprio Pääsihteeri Sakari Karjalainen Pankinjohtaja Kari Markkula Pankinjohtaja Riitta Pyhälä Työvaliokunta kokoontui seitsemän kertaa. Työvaliokunta on yhteinen Suomen Syöpäyhdistyksen kanssa. Raha-asiainvaliokunta Pankinjohtaja Kari Markkula, puheenjohtaja Toimitusjohtaja Timo Ritakallio, varapuheenjohtaja Pääsihteeri Sakari Karjalainen Professori Teuvo Tammela Professori Tapio Visakorpi Talous- ja hallintojohtaja Raija Jokila, sihteeri Raha-asiainvaliokunta kokoontui neljä kertaa. Raha-asiainvaliokunta on yhteinen Suomen Syöpäyhdistyksen kanssa. Tilintarkastajat Suomen Syöpäyhdistyksen tilintarkastajina olivat KHT Samuli Perälä ja KHT Jaana Salmi. Heidän henkilökohtaisia varamiehiään olivat KHT Timo Etelämäki ja KHT Sauli Salmi.